Para la perspectiva metodológica de los cursos “MOOC Zero”, se ha propuesto utilizar el modelo pedagógico de las 4/5E, siendo un modelo propuesto por Rodger W. Bybee, quien lideró el equipo de Biological Science Curriculum Study (BSCS), proponiendo un modelo basado desde la teoría de aprendizaje del constructivismo, que a partir de experiencias e interacciones con el entorno se fomente el aprendizaje activo, donde los estudiantes participen directamente en el proceso de descubrimiento y desarrollo de conceptos. El modelo 4/E aplicado a “MOOC Zero”, consiste en construir cada unidad con el siguiente esquema: Enganche, Explicación, Exploración y Evaluación.